Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
SgcaP82350 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms