Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Irx1P81068 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
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