Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx2P80206 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms