Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Hoxd13P70217 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Hoxd13P70217 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Hoxd13P70217 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Hoxd13P70217 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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