Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rab3cP62823 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rab3cP62823 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms