Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Snrpd1P62315 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Snrpd1P62315 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Snrpd1P62315 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Snrpd1P62315 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Snrpd1P62315 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Snrpd1P62315 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Snrpd1P62315 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Snrpd1P62315 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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