Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Usp46P62069 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms