Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vbp1P61759 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Vbp1P61759 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vbp1P61759 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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