Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sf3b6P59708 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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