Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp25P57080 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp25P57080 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms