Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Sh3bp1P55194 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Sh3bp1P55194 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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