Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rad23bP54728 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rad23bP54728 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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