Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
FmodP50608 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
FmodP50608 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
FmodP50608 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms