Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Tmod1P49813 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms