Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
GdnfP48540 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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