Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
VdrP48281 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VdrP48281 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms