Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cdkn1bP46414 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms