Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TtlP38585 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TtlP38585 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.5 ms