Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Upk2P38575 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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