Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtprmP28828 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm16210-201ENSMUST00000122161 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 4930505M18Rik-201ENSMUST00000175854 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Krtap6-3-202ENSMUST00000185581 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Krtap6-3-201ENSMUST00000079151 444 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtprmP28828 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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