Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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RxraP28700 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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RxraP28700 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RxraP28700 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RxraP28700 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxraP28700 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxraP28700 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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RxraP28700 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RxraP28700 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
RxraP28700 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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