Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Slc6a9P28571 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms