Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RarbP22605 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RarbP22605 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RarbP22605 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RarbP22605 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RarbP22605 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RarbP22605 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RarbP22605 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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