Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Fcer1aP20489 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Fcer1aP20489 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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