Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
PrkcaP20444 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms