Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
P18528 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
P18528 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P18528 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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