Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb1P17919 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms