Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Nr4a1P12813 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms