Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm5142-201ENSMUST00000066558 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Lsmem1-202ENSMUST00000220951 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxb4P10284 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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