Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm10488-201ENSMUST00000101657 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm4836-201ENSMUST00000179874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm10096-202ENSMUST00000180207 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm10487-202ENSMUST00000180344 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm26907-201ENSMUST00000181794 729 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Ipcef1-202ENSMUST00000086896 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ly6c1P0CW02 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ly6c1P0CW02 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms