Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
SparcP07214 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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SparcP07214 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SparcP07214 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SparcP07214 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SparcP07214 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms