Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01663 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01663 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01663 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01663 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01663 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms