Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P01661 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
P01661 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01661 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms