Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kdm6aO70546 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kdm6aO70546 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kdm6aO70546 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kdm6aO70546 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kdm6aO70546 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Kdm6aO70546 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Kdm6aO70546 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms