Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm11298-201ENSMUST00000120503 1799 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm13140-201ENSMUST00000119840 3151 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Marveld2-204ENSMUST00000225754 3111 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ptpn20O55082 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms