Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Copb2O55029 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
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Copb2O55029 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Copb2O55029 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Copb2O55029 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Copb2O55029 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Copb2O55029 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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