Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Cbfa2t2-201ENSMUST00000045270 6069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Eif2ak4-201ENSMUST00000005233 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
CrxO54751 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Adam22-204ENSMUST00000088761 9077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Ap2b1-201ENSMUST00000018875 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
CrxO54751 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CrxO54751 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms