Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Nek2O35942 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms