Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edil3O35474 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms