Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atf6bO35451 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atf6bO35451 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms