Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Prrt1O35449 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
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Prrt1O35449 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Prrt1O35449 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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