Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Foxd2O35392 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Foxd2O35392 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms