Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Alx4O35137 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms