Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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MttpO08601 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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MttpO08601 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
MttpO08601 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MttpO08601 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MttpO08601 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
MttpO08601 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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MttpO08601 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MttpO08601 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
MttpO08601 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms