Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Efna3O08545 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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