Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Gm2056J3QQ02 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Gm2056J3QQ02 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms