Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Gm20795J3QP49 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms