Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3727J3QM54 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3727J3QM54 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3727J3QM54 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3727J3QM54 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm3727J3QM54 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm3727J3QM54 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
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