Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cldn34c3J3QJW5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Cldn34c3J3QJW5 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
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