Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21818J3KMS6 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21818J3KMS6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21818J3KMS6 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Gm21818J3KMS6 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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